Nygårdskirken er opført i 1966 og indviet samme år af biskop over Helsingør Stift J.B. Leer Andersen. Kirken fungerede som annekskirke i Brøndbyøster Sogn indtil 1979, hvor kirken blev sognekirke i det nyoprettede Nygård Sogn.
Kirkens sidebygning med kontorer og lokaler er opført i årene derefter; den seneste udvidelse fandt sted i 1991.
Nygårdskirken er opført i fyrretræ og eternitplader og har 180 siddepladser.
Kirken har fritstående alter, knæfald, prædikestol og stel til dåbsfad udført i fyrretræ; lysestager, dåbsfad, dåbskande og altersæt i tin; særkalke i sølv. Korvæggen er udsmykket med et enkelt, guldbelagt trækors.